75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16052 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  100 
 
 		 271 aa  554  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 479 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  29.24 
 
 		 448 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  29.63 
 
 		 454 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  30 
 
 		 454 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  28.75 
 
 		 444 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  29.59 
 
 		 416 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 		 491 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  28.93 
 
 		 443 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  26.71 
 
 		 444 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  28.04 
 
 		 543 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  29.49 
 
 		 541 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 509 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  30 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.49 
 
 		 447 aa  79  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  21.4 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  25.17 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  25.79 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  27.81 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  27.31 
 
 		 542 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  31.28 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  33.55 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  30.43 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.06 
 
 		 727 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  31.28 
 
 		 460 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  27.04 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  25.53 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  23.71 
 
 		 492 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  24.56 
 
 		 437 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  27.04 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  26.26 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  24.27 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  21.94 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 462 aa  62.4  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  26.38 
 
 		 544 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  27.45 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  22.52 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 		 474 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  23.87 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  26.79 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  27.68 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  22.02 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  28.93 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 448 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 463 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  25.96 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  29.6 
 
 		 442 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  26.97 
 
 		 521 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  27.78 
 
 		 442 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 560 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  26.44 
 
 		 402 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  26.81 
 
 		 649 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  26.19 
 
 		 470 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.22 
 
 		 865 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  24.23 
 
 		 602 aa  48.9  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  22.8 
 
 		 528 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  24.39 
 
 		 537 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  22.16 
 
 		 508 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 458 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 458 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 458 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46492  predicted protein  24.46 
 
 		 563 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  22.56 
 
 		 665 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 665 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 664 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 		 665 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  25.6 
 
 		 399 aa  42.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>