71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1396 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  63.06 
 
 		 641 aa  810    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  100 
 
 		 642 aa  1308    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  45.65 
 
 		 633 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  36.02 
 
 		 669 aa  316  8e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  33.64 
 
 		 931 aa  300  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  38.52 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  25.62 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  31.03 
 
 		 814 aa  71.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  22.83 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  36.81 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  31.15 
 
 		 665 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  29.28 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  33.76 
 
 		 1392 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  26.54 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  35.25 
 
 		 865 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  32.41 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  35.71 
 
 		 518 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  39 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  33.33 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  40.4 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.65 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  37 
 
 		 373 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  25.29 
 
 		 649 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  31.67 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  31.06 
 
 		 246 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  32.03 
 
 		 723 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  36.44 
 
 		 537 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  35.8 
 
 		 372 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 		 460 aa  55.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  26.67 
 
 		 975 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 		 463 aa  54.7  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  27.96 
 
 		 492 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 		 446 aa  54.3  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  39.39 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  28.3 
 
 		 541 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  38.68 
 
 		 528 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  39.17 
 
 		 606 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  38.38 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1405 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  36 
 
 		 1413 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  28.15 
 
 		 489 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  24.72 
 
 		 431 aa  52.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 		 442 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  26.49 
 
 		 390 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 518 aa  51.2  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 		 491 aa  50.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  29.23 
 
 		 755 aa  50.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  34.44 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  25.44 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  29.66 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  36.04 
 
 		 444 aa  48.9  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6273  hypothetical protein  43.33 
 
 		 503 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  25.56 
 
 		 444 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 		 474 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  30.66 
 
 		 530 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  25 
 
 		 750 aa  47.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  25 
 
 		 932 aa  47.4  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  30.51 
 
 		 544 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  26.32 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  30.36 
 
 		 475 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  33.59 
 
 		 659 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  36.08 
 
 		 521 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  33.04 
 
 		 454 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  33.59 
 
 		 659 aa  44.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  38.83 
 
 		 916 aa  44.3  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  42.5 
 
 		 605 aa  44.3  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  31.62 
 
 		 604 aa  43.9  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>