32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3593 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  100 
 
 
723 aa  1432    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  44.32 
 
 
755 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  47.81 
 
 
748 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  32.03 
 
 
649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  29.43 
 
 
576 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  31.8 
 
 
1011 aa  90.9  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07117  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 
458 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.23 
 
 
790 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.17 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  32.13 
 
 
1405 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  35.04 
 
 
502 aa  75.1  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  33.13 
 
 
750 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  46.3 
 
 
669 aa  72  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  33.13 
 
 
932 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  30.73 
 
 
1413 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 
594 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 
491 aa  65.1  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  31.53 
 
 
372 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 
482 aa  60.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  34.29 
 
 
496 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0632  hypothetical protein  25.35 
 
 
809 aa  57.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  31.76 
 
 
931 aa  57.4  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0657  hypothetical protein  25.35 
 
 
809 aa  57.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  32.03 
 
 
642 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  34.19 
 
 
1049 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  28.95 
 
 
814 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  29.49 
 
 
312 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  21.61 
 
 
1323 aa  51.2  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  28.12 
 
 
633 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  33.64 
 
 
665 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  33.65 
 
 
1392 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  25.13 
 
 
864 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>