28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01850 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  100 
 
 		 1323 aa  2636    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0632  hypothetical protein  28.9 
 
 		 809 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0657  hypothetical protein  28.9 
 
 		 809 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1740  hypothetical protein  26.74 
 
 		 885 aa  251  5e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.98 
 
 		 790 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  30.09 
 
 		 576 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  38.43 
 
 		 739 aa  123  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  39.27 
 
 		 739 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  37.44 
 
 		 846 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  38.19 
 
 		 767 aa  103  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 757 aa  89  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  33.13 
 
 		 718 aa  75.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07117  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 458 aa  67.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  25 
 
 		 1025 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  26.71 
 
 		 755 aa  65.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  22.89 
 
 		 748 aa  61.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 1013 aa  59.3  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  31.69 
 
 		 475 aa  53.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  28.64 
 
 		 736 aa  50.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  26.52 
 
 		 992 aa  49.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  24.48 
 
 		 739 aa  48.5  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0857  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.82 
 
 		 619 aa  47.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  22.65 
 
 		 2073 aa  47  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  40.91 
 
 		 583 aa  46.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  53.57 
 
 		 542 aa  46.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.92 
 
 		 523 aa  45.8  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  38.1 
 
 		 456 aa  45.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 1479 aa  45.1  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>