31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  100 
 
 		 992 aa  2002    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  38.57 
 
 		 1065 aa  493  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  30.4 
 
 		 739 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 583 aa  194  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  33.52 
 
 		 324 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  35.8 
 
 		 348 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  38.69 
 
 		 340 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  31.13 
 
 		 345 aa  114  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  28.18 
 
 		 323 aa  106  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  32.71 
 
 		 318 aa  98.6  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08472  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 346 aa  93.6  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.327023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.97 
 
 		 982 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.99 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  26.84 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  23.49 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 644 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  22.86 
 
 		 314 aa  63.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  30.57 
 
 		 3320 aa  57  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  26.21 
 
 		 675 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  23.14 
 
 		 342 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  27.07 
 
 		 377 aa  55.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.54 
 
 		 478 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  27.08 
 
 		 304 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  26.52 
 
 		 1323 aa  49.7  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  36.22 
 
 		 1121 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  20.67 
 
 		 311 aa  48.5  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  26.89 
 
 		 846 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 		 1121 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 		 1121 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  33.33 
 
 		 1174 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  34.51 
 
 		 1112 aa  44.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>