26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1692 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 		 523 aa  991    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  37.85 
 
 		 1101 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.03 
 
 		 864 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  29.44 
 
 		 714 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1164 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1931 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.2 
 
 		 1064 aa  67  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.23 
 
 		 1147 aa  64.3  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  29.71 
 
 		 948 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  29.15 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  28.45 
 
 		 958 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  26.09 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  36.36 
 
 		 6678 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  34.34 
 
 		 4357 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1576 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 1121 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  29.68 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  27.46 
 
 		 767 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 1121 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.13 
 
 		 14944 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  25.94 
 
 		 1323 aa  44.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  32.5 
 
 		 1121 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  24.37 
 
 		 1112 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5589  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.58 
 
 		 1292 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.35 
 
 		 739 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  32.98 
 
 		 564 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>