34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4268 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  35.56 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  29.62 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  30.65 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  33.96 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.22 
 
 		 1679 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  26.09 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  25.6 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  27.68 
 
 		 1072 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  28.76 
 
 		 471 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  27.19 
 
 		 848 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  32.61 
 
 		 1081 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.75 
 
 		 523 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  28.24 
 
 		 1310 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.19 
 
 		 6678 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  26.41 
 
 		 531 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  23.32 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  28.64 
 
 		 14944 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  23.43 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  22.67 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  25.24 
 
 		 4761 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1101 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  23.98 
 
 		 703 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  27.23 
 
 		 1013 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.25 
 
 		 442 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1576 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  26.42 
 
 		 846 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.04 
 
 		 1147 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  24.88 
 
 		 981 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28 
 
 		 864 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1931 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  23.75 
 
 		 424 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  21.86 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>