40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3200 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  30.95 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  34.35 
 
 		 471 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.69 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  31.42 
 
 		 564 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  27.19 
 
 		 429 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  27.6 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.34 
 
 		 1679 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  23.81 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  24.7 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  23.92 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1081 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  27.27 
 
 		 848 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  27.31 
 
 		 3907 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 1121 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  27.52 
 
 		 1121 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 		 1121 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  25.6 
 
 		 1072 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  23.81 
 
 		 4761 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  23.75 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  34.07 
 
 		 4433 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  26.96 
 
 		 531 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.19 
 
 		 442 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  23.74 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  22.69 
 
 		 3861 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  26.32 
 
 		 1310 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1367 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  23.32 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  24.12 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  35 
 
 		 3507 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.57 
 
 		 6678 aa  45.8  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  23.67 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  23.25 
 
 		 1306 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.44 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 1143 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  23.73 
 
 		 1035 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  23.85 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 		 1112 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  22.33 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  27.93 
 
 		 14944 aa  42.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>