45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0666 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  91.09 
 
 		 258 aa  480  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  47.71 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  50.21 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  50 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  48.7 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  42.37 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  39.76 
 
 		 848 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  37.11 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  39.15 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  37.79 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  40.54 
 
 		 804 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  35.48 
 
 		 703 aa  132  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  32.17 
 
 		 1121 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  34.82 
 
 		 1143 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  34.98 
 
 		 1121 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 		 1121 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 1112 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  33.79 
 
 		 1174 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  25.67 
 
 		 739 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.8 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  28.17 
 
 		 767 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  25.88 
 
 		 739 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  28.32 
 
 		 846 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  25.11 
 
 		 1013 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  24.14 
 
 		 741 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  24.14 
 
 		 741 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  23.08 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  24.63 
 
 		 741 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.8 
 
 		 864 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  25 
 
 		 1306 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  26.79 
 
 		 757 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  22.32 
 
 		 1310 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  31.4 
 
 		 4357 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  23.39 
 
 		 471 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  26.14 
 
 		 6678 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  32.99 
 
 		 4761 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  29.67 
 
 		 531 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  25.32 
 
 		 429 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.9 
 
 		 11716 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.35 
 
 		 1679 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  31.58 
 
 		 3507 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1633  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.42 
 
 		 1035 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>