123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1622 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 703 aa  1443    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  71.23 
 
 		 804 aa  749    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  52.14 
 
 		 789 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  52.88 
 
 		 707 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  49.67 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  49.24 
 
 		 494 aa  445  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  47.71 
 
 		 475 aa  432  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  49.46 
 
 		 476 aa  432  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.42 
 
 		 810 aa  432  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  42.44 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  43.27 
 
 		 471 aa  382  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  42.92 
 
 		 1121 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  41.75 
 
 		 1121 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  43.67 
 
 		 1121 aa  360  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  43.8 
 
 		 1112 aa  360  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  39.27 
 
 		 848 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  38.52 
 
 		 1143 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  37.22 
 
 		 1174 aa  300  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  28.21 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  36.7 
 
 		 249 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  38.43 
 
 		 251 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  29.31 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  30.39 
 
 		 581 aa  139  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  33.61 
 
 		 250 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  34.96 
 
 		 250 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  35.48 
 
 		 258 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  34.96 
 
 		 250 aa  131  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  34.1 
 
 		 258 aa  130  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0667  LamG domain-containing protein  32.27 
 
 		 247 aa  125  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  32.2 
 
 		 247 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  33.02 
 
 		 250 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  28.16 
 
 		 456 aa  112  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 		 331 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.62 
 
 		 343 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  30.23 
 
 		 315 aa  95.1  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.69 
 
 		 352 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.11 
 
 		 357 aa  91.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  30.85 
 
 		 598 aa  90.5  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.69 
 
 		 319 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.07 
 
 		 355 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.61 
 
 		 355 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.94 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.61 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.71 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  32.31 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.32 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  24.94 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25.86 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.62 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.08 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  29.79 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  24.49 
 
 		 503 aa  73.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28 
 
 		 327 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.83 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  23.49 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  24 
 
 		 306 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  23.57 
 
 		 829 aa  58.9  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  28.02 
 
 		 846 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  29.84 
 
 		 380 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  24.07 
 
 		 527 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  23.12 
 
 		 304 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  27 
 
 		 505 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 315 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 315 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  26.34 
 
 		 386 aa  54.7  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25.38 
 
 		 509 aa  54.7  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.55 
 
 		 699 aa  54.3  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 315 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  28.1 
 
 		 757 aa  53.9  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  26.24 
 
 		 401 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  23.94 
 
 		 531 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  28.71 
 
 		 480 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  22.51 
 
 		 487 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.81 
 
 		 501 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  26.83 
 
 		 767 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  23.77 
 
 		 536 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.3 
 
 		 598 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  25.87 
 
 		 316 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  24.18 
 
 		 522 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.37 
 
 		 3507 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  25.13 
 
 		 1013 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  23.31 
 
 		 739 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  21.35 
 
 		 323 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  25.43 
 
 		 252 aa  48.5  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 345 aa  48.1  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  23.56 
 
 		 741 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.62 
 
 		 510 aa  48.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  21.98 
 
 		 383 aa  47.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  21.9 
 
 		 330 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  23.77 
 
 		 522 aa  47.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  23.98 
 
 		 313 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  23.57 
 
 		 739 aa  47.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  22.58 
 
 		 754 aa  47.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  29.91 
 
 		 497 aa  47.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.53 
 
 		 551 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  23.56 
 
 		 741 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  23.56 
 
 		 741 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  24.89 
 
 		 533 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  27.98 
 
 		 3861 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.67 
 
 		 546 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>