More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1087 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 598 aa  1200    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.13 
 
 		 585 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.25 
 
 		 599 aa  571  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  52.55 
 
 		 615 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  52.49 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.98 
 
 		 655 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.54 
 
 		 671 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.74 
 
 		 680 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.85 
 
 		 594 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.95 
 
 		 607 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.74 
 
 		 555 aa  415  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.39 
 
 		 551 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  40.78 
 
 		 555 aa  332  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  28.33 
 
 		 756 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  28.33 
 
 		 756 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  28.33 
 
 		 756 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  31.7 
 
 		 259 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  31.98 
 
 		 241 aa  100  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  30.32 
 
 		 257 aa  99.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  34.27 
 
 		 236 aa  100  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.88 
 
 		 225 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  30.32 
 
 		 257 aa  99.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  31.44 
 
 		 231 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  34.3 
 
 		 236 aa  98.2  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  33.82 
 
 		 236 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.75 
 
 		 229 aa  97.4  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 		 221 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.88 
 
 		 243 aa  97.4  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  30.52 
 
 		 231 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.52 
 
 		 231 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  30.88 
 
 		 259 aa  95.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 		 229 aa  95.1  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  33.19 
 
 		 229 aa  95.5  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  27.63 
 
 		 376 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  31.08 
 
 		 233 aa  94.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  31.08 
 
 		 233 aa  94.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 		 227 aa  94.4  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  30.97 
 
 		 234 aa  94.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  30.52 
 
 		 231 aa  94  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  30.52 
 
 		 231 aa  94  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  30.52 
 
 		 231 aa  94  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  30.52 
 
 		 231 aa  94  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  46.23 
 
 		 239 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  30.64 
 
 		 229 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  35.37 
 
 		 238 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  37.04 
 
 		 238 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  29.58 
 
 		 231 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  35.37 
 
 		 238 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  30.84 
 
 		 227 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  30.77 
 
 		 239 aa  92.8  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  29.58 
 
 		 231 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  35.37 
 
 		 238 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  28.05 
 
 		 224 aa  92  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  28.05 
 
 		 224 aa  92  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.48 
 
 		 224 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  30.37 
 
 		 228 aa  91.7  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  31.84 
 
 		 220 aa  91.3  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  29.72 
 
 		 226 aa  90.9  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  30.2 
 
 		 223 aa  90.5  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.29 
 
 		 268 aa  90.5  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.56 
 
 		 231 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.97 
 
 		 228 aa  90.5  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  46.23 
 
 		 239 aa  90.1  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  33.54 
 
 		 238 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  31.02 
 
 		 234 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  28.99 
 
 		 263 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  32.41 
 
 		 239 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  40.65 
 
 		 248 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.55 
 
 		 224 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 		 229 aa  89.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.03 
 
 		 231 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  33.54 
 
 		 238 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.09 
 
 		 236 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  30.66 
 
 		 227 aa  89  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.48 
 
 		 234 aa  88.6  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  29.44 
 
 		 235 aa  88.6  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.73 
 
 		 238 aa  88.2  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 		 229 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  31.58 
 
 		 241 aa  87.8  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  29.74 
 
 		 228 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  29.74 
 
 		 228 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  29.74 
 
 		 228 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  29.68 
 
 		 228 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  32 
 
 		 236 aa  87.8  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.8 
 
 		 228 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.8 
 
 		 228 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 		 299 aa  87  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  31.53 
 
 		 227 aa  87  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  29.22 
 
 		 228 aa  87  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  29.22 
 
 		 228 aa  87  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.22 
 
 		 229 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.31 
 
 		 228 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  29.22 
 
 		 274 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 229 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.8 
 
 		 228 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  29.49 
 
 		 228 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  29.22 
 
 		 225 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.8 
 
 		 228 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>