More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2119 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  61.97 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  59.17 
 
 		 236 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.61 
 
 		 237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  61.82 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.68 
 
 		 237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  60.43 
 
 		 236 aa  281  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  58.44 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  60 
 
 		 236 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  60.27 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  58.87 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.97 
 
 		 237 aa  278  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  60 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.97 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  58.62 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.82 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.91 
 
 		 243 aa  274  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  57.02 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  56.85 
 
 		 238 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  60.35 
 
 		 238 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  59.47 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  59.91 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  59.47 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  59.91 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.21 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  55.75 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  56.78 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.17 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.01 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  52.84 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.82 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  54.82 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.82 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.39 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  48.9 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.95 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.16 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  47.93 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  47.93 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  47.93 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.1 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.93 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.47 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.64 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1108  Tol-Pal system TolQ  52.97 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00793891  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.17 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  48.17 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.43 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.54 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.18 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  47.09 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  49.31 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.33 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  49.31 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  48.17 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 		 221 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  50 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.71 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.17 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.33 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.79 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  50.23 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  50.92 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  50.92 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  50.92 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  46.33 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  50.92 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  47.03 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  46.96 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  45.25 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  47.51 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.64 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  46.58 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  48.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  48.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  48.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  48.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  45.45 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  47.25 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  47.95 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  45.98 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.4 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  47.03 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  43.98 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  43.98 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.39 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  44.17 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  45.41 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.04 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.95 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.12 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  47.95 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>