More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3325 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  32.44 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  33.33 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  33.17 
 
 		 238 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  31.65 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  31.48 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  31.19 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.13 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  31.25 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  36.32 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  33.17 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  30.77 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  30.14 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  30.14 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  30.23 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  30.77 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  32.09 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  32.09 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.42 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  31.63 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.7 
 
 		 313 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  29.25 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.84 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.42 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  32.31 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.63 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.92 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  29.33 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  29.33 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.38 
 
 		 320 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.28 
 
 		 267 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.36 
 
 		 237 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  28.9 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.36 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  31.1 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  35.89 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  35.9 
 
 		 320 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  31.31 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  33.5 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  36.08 
 
 		 326 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  29.33 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  29.81 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  29.8 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  30.73 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.06 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  35.38 
 
 		 324 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  35.05 
 
 		 318 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  28.38 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.11 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  31.58 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  29.09 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.52 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  27.52 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  31.71 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.44 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  28.76 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.41 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  31.71 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 		 337 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  32.49 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  32.21 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  32.21 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.05 
 
 		 320 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  28.99 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  35.38 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  30.19 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  33.85 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  28.04 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.94 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  28.18 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.18 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.57 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  31.16 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.37 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  29.73 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  31.16 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.22 
 
 		 308 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.44 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.31 
 
 		 288 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  29.81 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.58 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.49 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.97 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.02 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.45 
 
 		 230 aa  92.8  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  28.18 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  31.4 
 
 		 359 aa  92.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>