More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1014 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.55 
 
 		 232 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  58.93 
 
 		 232 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.39 
 
 		 227 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  48.64 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  46.96 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.46 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  47.64 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  47.64 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  46.09 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  46.09 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  47.17 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  46.09 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  47.66 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  47.64 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.69 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  47.2 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  47.64 
 
 		 274 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  46.05 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.26 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  42.99 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.62 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  45.33 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.81 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  45 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  45.05 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  43.56 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.93 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  43.11 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  45.74 
 
 		 238 aa  181  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.8 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.09 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.86 
 
 		 243 aa  174  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  40.97 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  44.2 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  43.93 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  43.93 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.93 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  43.93 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  43.93 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  43.93 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  43.46 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.46 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  43.93 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  43.46 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  41.4 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  41.18 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.93 
 
 		 232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  40.62 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  42.01 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.6 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.09 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.25 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  39.17 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  39.17 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.66 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  39.17 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  41.18 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.17 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  40.81 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.52 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.33 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.33 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.89 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  41.51 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  40.64 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  37.79 
 
 		 227 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.32 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  36.99 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  36.99 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  39.91 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  39.91 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.91 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.91 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  39.91 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.07 
 
 		 299 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  41.28 
 
 		 303 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  39.91 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  36.41 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  39.56 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.25 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  39.46 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.58 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  38.57 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  36.53 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.31 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  39.81 
 
 		 359 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  40.19 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  46.43 
 
 		 313 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.26 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  38.57 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>