More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3581 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 299 aa  588  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  40.73 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  43.91 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.06 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.26 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.59 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  42.39 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  40.3 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  43.42 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  38.74 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.59 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  41.85 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  42.19 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  42.8 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  42.04 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  41.73 
 
 		 274 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  42.06 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  42.69 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.48 
 
 		 246 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  42.22 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.53 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  39.16 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.7 
 
 		 237 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  43.48 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  42.06 
 
 		 238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  38.43 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  41.78 
 
 		 238 aa  165  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.44 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  42.18 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  41.78 
 
 		 238 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  43.67 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  39.65 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.56 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  43.17 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  43.73 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.56 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  42.92 
 
 		 325 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.98 
 
 		 421 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  42.6 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  39.93 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.64 
 
 		 247 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  46.02 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  46.02 
 
 		 239 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  42.73 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.61 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  46.32 
 
 		 348 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  42.32 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  42.37 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  42.86 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  42.24 
 
 		 239 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.13 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.91 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  40.53 
 
 		 348 aa  158  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.66 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.07 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  42.29 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  42.61 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 		 266 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  42.29 
 
 		 236 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.83 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  41.32 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  41.85 
 
 		 236 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.95 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.7 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  41.33 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  41.33 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  42.11 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  41.33 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  42.11 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  42.11 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  41.33 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  43.61 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  41.33 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  41.33 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  42.11 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.512684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  41.33 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  42.11 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  41.33 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  42.44 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.97 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  41.78 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  40 
 
 		 241 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  40.89 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.53 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.05 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.52 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.61 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  37.55 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.33 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  42.17 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  40.97 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.17 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  38.57 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  38.33 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>