More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2357 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 265 aa  510  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  80.44 
 
 		 265 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  69.75 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.4 
 
 		 266 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  69.47 
 
 		 283 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  68 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.07 
 
 		 400 aa  246  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.22 
 
 		 421 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  54.04 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.42 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.14 
 
 		 286 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  57.02 
 
 		 338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  56.83 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  53.68 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  57.46 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  55.66 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.05 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  57.02 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  53.57 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  53.57 
 
 		 326 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  53.57 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.81 
 
 		 288 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  53.3 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  53.18 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  53.28 
 
 		 359 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  54.21 
 
 		 318 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.21 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.41 
 
 		 301 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.85 
 
 		 366 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.16 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  49.2 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  53.88 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.73 
 
 		 337 aa  214  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  52.51 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  52.51 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  53.67 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  53.67 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  52.51 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  52.51 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  52.51 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  52.51 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  52.51 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  53.67 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  53.67 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.512684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  52.51 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  53.67 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  52.05 
 
 		 244 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  50.46 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.94 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  52.75 
 
 		 336 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  50.92 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.8 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.57 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  55.81 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  52.29 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  54.85 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  49.32 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  53.24 
 
 		 316 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  52.31 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  53.11 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.42 
 
 		 363 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  52.63 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  51.98 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  52.15 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.38 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  50.7 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  52.4 
 
 		 323 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  51.72 
 
 		 335 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  48.9 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.3 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  42.64 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.58 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0173  putative tonB-system energizer ExbB  56.49 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  40.37 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  38.25 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.24 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.66 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  36.89 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  38.22 
 
 		 232 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.56 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.01 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  42.29 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  40.36 
 
 		 232 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1395  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.59 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  41.58 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.83 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  37.13 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.32 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  37.17 
 
 		 238 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  40.59 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  40.59 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0857  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.7 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.27 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.27 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  41.09 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  37.86 
 
 		 236 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>