More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3137 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 247 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.3 
 
 		 246 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.73 
 
 		 308 aa  198  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  48.64 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  43.8 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.7 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.13 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  43.15 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.4 
 
 		 237 aa  174  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.26 
 
 		 237 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.17 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  41.77 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  43.22 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  44.07 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  46.12 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  43.64 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  41.84 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  42.37 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  45.02 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  43.22 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.36 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  41.74 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  43.04 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.53 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  42.55 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  42.55 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  42.55 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.85 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  43.04 
 
 		 239 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.75 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  40.16 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.61 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  42.06 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.43 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  41.56 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.24 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.32 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.74 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1395  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.06 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  39.42 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.74 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  40.17 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.76 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.29 
 
 		 301 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  44.2 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.2 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  39.37 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.2 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  40.25 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.27 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  44.19 
 
 		 316 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  43.01 
 
 		 253 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 		 317 aa  141  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.48 
 
 		 286 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.59 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  41.15 
 
 		 323 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.67 
 
 		 366 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  43.55 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  39.75 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0857  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.33 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  41.41 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  41.41 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.44 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  35.56 
 
 		 230 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.18 
 
 		 431 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  39.44 
 
 		 324 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  43.35 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  41.07 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  40.89 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.02 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  35.11 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.12 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  39.47 
 
 		 348 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  41.52 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  40 
 
 		 355 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 		 313 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  43.9 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  43.9 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  43.53 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  43.9 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  43.9 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.512684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  43.9 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2146  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.36 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.28 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  41.86 
 
 		 318 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  38.57 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  41.33 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  43.75 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  35.14 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  38.99 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.99 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.96 
 
 		 337 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.02 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  37.61 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.67 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.2 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  39.08 
 
 		 359 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  36.74 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>