More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3413 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  99.59 
 
 		 244 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  99.59 
 
 		 244 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  99.59 
 
 		 244 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  99.59 
 
 		 244 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.512684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  89.75 
 
 		 244 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  89.75 
 
 		 244 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  89.75 
 
 		 244 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  89.75 
 
 		 244 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  89.75 
 
 		 244 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  89.75 
 
 		 244 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  89.75 
 
 		 244 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  89.75 
 
 		 244 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  89.34 
 
 		 244 aa  441  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  87.03 
 
 		 238 aa  424  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  76.45 
 
 		 332 aa  377  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  76.45 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  72.73 
 
 		 304 aa  357  8e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  72.61 
 
 		 296 aa  353  8.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  75.85 
 
 		 323 aa  341  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  70.76 
 
 		 345 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  70.34 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  70.76 
 
 		 237 aa  311  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  64.19 
 
 		 359 aa  285  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.09 
 
 		 320 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  61.09 
 
 		 318 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  61.57 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  61.57 
 
 		 326 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  61.57 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.17 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  62.73 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.25 
 
 		 400 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.25 
 
 		 421 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  57.73 
 
 		 309 aa  240  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.56 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.36 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.2 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  53.45 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.71 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.05 
 
 		 313 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  54.02 
 
 		 292 aa  224  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  53.78 
 
 		 338 aa  224  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  51.68 
 
 		 348 aa  224  9e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  54.91 
 
 		 327 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  51.88 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.8 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.13 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  55.71 
 
 		 355 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  53.33 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.66 
 
 		 288 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  56.76 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  53.74 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.38 
 
 		 294 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.94 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.67 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  54.13 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  51.3 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.02 
 
 		 431 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  51.52 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  57.87 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  54.95 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.92 
 
 		 337 aa  205  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  52 
 
 		 316 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.04 
 
 		 318 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.38 
 
 		 320 aa  201  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  48.98 
 
 		 265 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.35 
 
 		 355 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  55.3 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  50.89 
 
 		 349 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  40.87 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  43.84 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  45.05 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0173  putative tonB-system energizer ExbB  63.93 
 
 		 323 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  41.56 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  40.69 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.44 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  40.83 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  40.43 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.1 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  40.25 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.6 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  39.37 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  39.37 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  38.07 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  38.29 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  39.45 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.22 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  38.74 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.56 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.54 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 		 237 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.6 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  40.59 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.86 
 
 		 237 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  38.65 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.81 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.86 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>