More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1308 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  93.64 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  91.53 
 
 		 237 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  94.22 
 
 		 227 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  89.83 
 
 		 237 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  90.68 
 
 		 237 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  89.41 
 
 		 237 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  75.11 
 
 		 274 aa  355  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  67.63 
 
 		 248 aa  325  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  68.22 
 
 		 241 aa  324  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  66.81 
 
 		 238 aa  321  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  66.38 
 
 		 238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  66.81 
 
 		 238 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  65.53 
 
 		 238 aa  318  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  65.53 
 
 		 238 aa  317  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  65.53 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  65.37 
 
 		 236 aa  304  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  64.94 
 
 		 236 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  64.94 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  65.18 
 
 		 239 aa  301  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  65.62 
 
 		 239 aa  300  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  65.18 
 
 		 239 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  63.16 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.11 
 
 		 243 aa  295  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  61.61 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  51.3 
 
 		 235 aa  248  6e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.51 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.62 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.55 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  52.65 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.78 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.91 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  48.91 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.78 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  47.77 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.89 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.29 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  44.5 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.95 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.05 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.32 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  43.32 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  43.32 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  43.32 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.73 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  43.58 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  47.35 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.02 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1108  Tol-Pal system TolQ  46.33 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00793891  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.45 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.89 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.24 
 
 		 232 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  41.63 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  42.73 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  43.44 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  41.18 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  41.94 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  43.24 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  41.94 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  42.79 
 
 		 225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.64 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.75 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  42.92 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  42.92 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  42.79 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  42.79 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  42.79 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  42.79 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  41.89 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  43.78 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  42.22 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  42.01 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  41.82 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.12 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.46 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  42.17 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  42.92 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  41.26 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.64 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.18 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  42.2 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  42.2 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  39.83 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  43.69 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.04 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  41.63 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  39.83 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>