More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0727 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 431 aa  830    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  71.49 
 
 		 292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  71.49 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  60.21 
 
 		 341 aa  313  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  57.89 
 
 		 338 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  63.09 
 
 		 316 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.47 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  57.45 
 
 		 325 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  62.78 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.72 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.33 
 
 		 363 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.25 
 
 		 400 aa  269  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.78 
 
 		 286 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.72 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  60.71 
 
 		 323 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.5 
 
 		 421 aa  263  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  62.16 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.16 
 
 		 288 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.34 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  60.43 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.14 
 
 		 301 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  63.09 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  59.56 
 
 		 326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  59.11 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  60.34 
 
 		 318 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  59.56 
 
 		 320 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.52 
 
 		 337 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  54.48 
 
 		 309 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  58.87 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.63 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  49.66 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.08 
 
 		 266 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  60.54 
 
 		 258 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.25 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.89 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.46 
 
 		 318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.37 
 
 		 294 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  48.71 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  50.5 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  56.88 
 
 		 303 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.8 
 
 		 320 aa  230  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  54.22 
 
 		 274 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  55.9 
 
 		 257 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.7 
 
 		 283 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  55.8 
 
 		 238 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.16 
 
 		 265 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  55.41 
 
 		 244 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  55.41 
 
 		 244 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  55.41 
 
 		 244 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  55.41 
 
 		 244 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  55.41 
 
 		 244 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.512684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  56 
 
 		 244 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  56 
 
 		 244 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  56 
 
 		 244 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  56 
 
 		 244 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  56 
 
 		 244 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  56 
 
 		 244 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  56 
 
 		 244 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  56 
 
 		 244 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  55.56 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  56.19 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  47.83 
 
 		 313 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  56.62 
 
 		 265 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  53.71 
 
 		 323 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  55.31 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  48.52 
 
 		 345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  56.68 
 
 		 242 aa  213  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  50.85 
 
 		 330 aa  209  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  53.31 
 
 		 304 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  53.95 
 
 		 237 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.19 
 
 		 299 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  46.29 
 
 		 241 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0173  putative tonB-system energizer ExbB  58.82 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  43.86 
 
 		 236 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.52 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  43.42 
 
 		 236 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  43.42 
 
 		 236 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.3 
 
 		 229 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 		 233 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  42.93 
 
 		 235 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 227 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.3 
 
 		 232 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.07 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 		 222 aa  146  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  43.11 
 
 		 238 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  40.27 
 
 		 232 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  40.81 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.06 
 
 		 237 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  42.35 
 
 		 251 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.09 
 
 		 247 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.24 
 
 		 237 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  41.74 
 
 		 232 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  39.24 
 
 		 236 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.37 
 
 		 243 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  39.83 
 
 		 237 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 		 227 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.43 
 
 		 237 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.73 
 
 		 236 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  42.24 
 
 		 239 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  42.29 
 
 		 236 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>