More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1146 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  100 
 
 		 325 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  68.75 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  63.52 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.33 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.43 
 
 		 355 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.43 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  64 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  59.57 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  61.18 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.27 
 
 		 431 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.09 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  59.65 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  57.58 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  55.42 
 
 		 309 aa  252  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.78 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  56.96 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  57.64 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  57.64 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  55.17 
 
 		 274 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  56.9 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.91 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  55.92 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  58.74 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.51 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  59.46 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  50.53 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.94 
 
 		 286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.79 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.79 
 
 		 421 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  55.2 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  55.17 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.48 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.19 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.19 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.28 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.62 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 267 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.4 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  53.85 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  53.78 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  55 
 
 		 348 aa  222  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  54.63 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  54.63 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  54.63 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  54.63 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.28 
 
 		 266 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  54.63 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  54.63 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  54.63 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  54.63 
 
 		 244 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  53.74 
 
 		 244 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  53.74 
 
 		 244 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  53.74 
 
 		 244 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  53.74 
 
 		 244 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  53.74 
 
 		 244 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.512684 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  54.19 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  48.76 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  54.19 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.89 
 
 		 283 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.3 
 
 		 265 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  53.51 
 
 		 336 aa  215  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  49.07 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  54.46 
 
 		 238 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  54.55 
 
 		 296 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  49.41 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  50 
 
 		 265 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  50.7 
 
 		 237 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  50.46 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  50.85 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  50 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0173  putative tonB-system energizer ExbB  62.2 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.74 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  43.17 
 
 		 241 aa  159  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1395  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.89 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  41.74 
 
 		 232 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.29 
 
 		 233 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.29 
 
 		 233 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.17 
 
 		 247 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  42.35 
 
 		 253 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  40.09 
 
 		 274 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  40.87 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.52 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 		 246 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  42.15 
 
 		 239 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.04 
 
 		 233 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  40.62 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  40.62 
 
 		 236 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.19 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  40.74 
 
 		 238 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  44 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.27 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 		 227 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  40.18 
 
 		 236 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.22 
 
 		 237 aa  142  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  43.56 
 
 		 239 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 		 237 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  40.25 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.36 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>