More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3499 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  100 
 
 		 239 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  98.74 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  87.45 
 
 		 239 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  87.92 
 
 		 239 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  80.85 
 
 		 236 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  80.43 
 
 		 236 aa  380  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  80 
 
 		 236 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  73.53 
 
 		 243 aa  360  8e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  66.67 
 
 		 274 aa  316  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.94 
 
 		 237 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.5 
 
 		 237 aa  304  9.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  65.62 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  66.81 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  65.93 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.76 
 
 		 237 aa  298  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.32 
 
 		 237 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.32 
 
 		 227 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  65.04 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  64.6 
 
 		 238 aa  291  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  64.16 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  64.6 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  62.77 
 
 		 238 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  60.27 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  62.16 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  58.19 
 
 		 241 aa  275  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  53.45 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.25 
 
 		 231 aa  238  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.02 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  53.65 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.61 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.65 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  51.3 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.3 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.55 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.81 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.46 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  49.13 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  48.85 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  48.85 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  48.85 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  49.08 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.39 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.85 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.85 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  49.54 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.85 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.44 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.39 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  48.64 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  48.64 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  46.67 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  46.67 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  46.67 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  46.67 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  48.17 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.17 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.79 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.29 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  46.58 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.75 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.93 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  44.44 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.33 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.79 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  45.5 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  44.64 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  45.45 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  45.25 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  42.01 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1108  Tol-Pal system TolQ  49.54 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00793891  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  42.01 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  44.64 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.45 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  45.45 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  45.45 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  45.45 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  45.45 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.45 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  45.45 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  44.29 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  45.45 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  42.6 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  45.7 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  43.84 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.04 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  45.5 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  45.21 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  45.5 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  45.25 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  44.14 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  46.58 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.58 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.15 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.15 
 
 		 242 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.58 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  46.15 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  44.8 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  45.7 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>