More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3417 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  100 
 
 
238 aa  480  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  87.03 
 
 
244 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  86.61 
 
 
244 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  86.61 
 
 
244 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  86.61 
 
 
244 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  86.61 
 
 
244 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.512684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  85.77 
 
 
244 aa  407  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  85.77 
 
 
244 aa  407  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  85.77 
 
 
244 aa  407  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  85.77 
 
 
244 aa  407  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  85.77 
 
 
244 aa  407  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  85.77 
 
 
244 aa  407  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  85.77 
 
 
244 aa  407  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  85.36 
 
 
244 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  85.77 
 
 
244 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  76.15 
 
 
332 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  76.57 
 
 
336 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  72.08 
 
 
296 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  70.29 
 
 
304 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  72.46 
 
 
323 aa  328  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  67.8 
 
 
345 aa  302  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  67.37 
 
 
330 aa  301  5.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  67.8 
 
 
237 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  66.82 
 
 
318 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  62.23 
 
 
359 aa  284  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.45 
 
 
320 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  62.61 
 
 
320 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  62.17 
 
 
326 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.64 
 
 
317 aa  277  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  61.74 
 
 
324 aa  277  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  63.64 
 
 
323 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  55.45 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.84 
 
 
400 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.84 
 
 
421 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  57.27 
 
 
303 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.59 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.16 
 
 
266 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  54.01 
 
 
327 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.36 
 
 
313 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  53.25 
 
 
292 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  52.61 
 
 
338 aa  225  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.85 
 
 
337 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  52.81 
 
 
310 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.41 
 
 
288 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  51.98 
 
 
257 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.94 
 
 
283 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.46 
 
 
301 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  55.45 
 
 
348 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.61 
 
 
366 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  57.47 
 
 
341 aa  220  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  54.05 
 
 
355 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.05 
 
 
294 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.91 
 
 
431 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.72 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  54.46 
 
 
325 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  50.86 
 
 
242 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.67 
 
 
337 aa  207  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  52.68 
 
 
316 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 
265 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  53.24 
 
 
258 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  55.84 
 
 
313 aa  204  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  47.44 
 
 
274 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  55.76 
 
 
348 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.46 
 
 
318 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.46 
 
 
320 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  50.46 
 
 
265 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.23 
 
 
355 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  53.92 
 
 
335 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  49.55 
 
 
349 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.55 
 
 
363 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  42.13 
 
 
251 aa  168  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  43.52 
 
 
253 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  40.91 
 
 
241 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0173  putative tonB-system energizer ExbB  63.11 
 
 
323 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  40.69 
 
 
239 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.18 
 
 
232 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  41.18 
 
 
239 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  41.63 
 
 
239 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  40.09 
 
 
238 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
299 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.59 
 
 
233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  38.63 
 
 
239 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.41 
 
 
227 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  39.46 
 
 
236 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  39.46 
 
 
236 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  38.64 
 
 
236 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 
308 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.36 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  38.18 
 
 
235 aa  138  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  39.46 
 
 
236 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  39.41 
 
 
236 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.64 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.45 
 
 
237 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.27 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  39.09 
 
 
274 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  38.94 
 
 
248 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.3 
 
 
229 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.22 
 
 
296 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  36.73 
 
 
238 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.73 
 
 
227 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>