More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2155 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 296 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.64 
 
 		 229 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1395  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.54 
 
 		 228 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.77 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.77 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.77 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0857  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.95 
 
 		 228 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  46.36 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  45.41 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  44.35 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  42.86 
 
 		 238 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  43.89 
 
 		 237 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  42.86 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.29 
 
 		 222 aa  159  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.57 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.61 
 
 		 231 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  45.3 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 		 237 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  42.61 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 		 237 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  44.87 
 
 		 236 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  45.3 
 
 		 236 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.04 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  42.61 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  42.61 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  44.05 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  41.56 
 
 		 236 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.08 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.05 
 
 		 238 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.28 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.79 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  41.15 
 
 		 229 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  42.44 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.54 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  40.64 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  40.64 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  40.64 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.43 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 		 227 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  41.18 
 
 		 228 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.18 
 
 		 228 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  38.99 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  41.07 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  39.73 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  41.07 
 
 		 230 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.82 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  42.86 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  40.45 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  45.45 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 		 228 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  40.45 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  40.91 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  38.5 
 
 		 229 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.27 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  40.69 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.19 
 
 		 236 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  40.44 
 
 		 239 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  40.74 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 		 229 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  46.11 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.45 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.71 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  41.81 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.34 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  46.91 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  40.55 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  41.81 
 
 		 239 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  38.79 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  39.91 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.84 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  42.93 
 
 		 227 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  41.95 
 
 		 232 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  38.99 
 
 		 228 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  38.99 
 
 		 228 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  40.87 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  40.91 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  48.44 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  44.9 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  43.48 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.71 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  44.39 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  44.71 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.19 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  45.26 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.29 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  43.48 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.39 
 
 		 231 aa  136  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.96 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  43.69 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  41.87 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  43.48 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>