More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0857 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0857  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1395  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.83 
 
 		 228 aa  350  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  76.19 
 
 		 229 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.11 
 
 		 233 aa  317  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.11 
 
 		 233 aa  317  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.68 
 
 		 233 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.95 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.28 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.32 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  46.61 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  45.96 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  46.7 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.09 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  44.44 
 
 		 248 aa  164  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  46.01 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  47.17 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  46.6 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  49.74 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  46.01 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  43.28 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  47.85 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  45.12 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.12 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  47.85 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  46.58 
 
 		 325 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  47.85 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.65 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.54 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  46.67 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  46.67 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  46.19 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  46.08 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.28 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  45.62 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.46 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  47.62 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  41.1 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  44.23 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.77 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.66 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  40.72 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.77 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  47.14 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  45.16 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.29 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  45.95 
 
 		 335 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  46.53 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  40.74 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.55 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  40.74 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.95 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  43.78 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  40.74 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  40.37 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.28 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  45.78 
 
 		 355 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  46.32 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  44.02 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.39 
 
 		 421 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.91 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.2 
 
 		 294 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.04 
 
 		 337 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  47.96 
 
 		 313 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  45.6 
 
 		 341 aa  148  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.71 
 
 		 317 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.39 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.46 
 
 		 337 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.12 
 
 		 366 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  43.9 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.26 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  44.39 
 
 		 274 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  45.09 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  40.43 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  40.43 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.98 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.25 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  43.26 
 
 		 318 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  41.63 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  42.08 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  41.95 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.43 
 
 		 286 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  41.86 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1108  Tol-Pal system TolQ  46.51 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00793891  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  41.4 
 
 		 332 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.78 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.89 
 
 		 431 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.98 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.3 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>