More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1108 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1108  Tol-Pal system TolQ  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00793891  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.45 
 
 		 232 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.55 
 
 		 232 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  74.55 
 
 		 232 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  71.23 
 
 		 231 aa  327  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.55 
 
 		 231 aa  315  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70 
 
 		 230 aa  290  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  52.97 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.49 
 
 		 243 aa  228  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  50.23 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  52.04 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  51.58 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  51.13 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  48.87 
 
 		 274 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  51.34 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  50.45 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  49.55 
 
 		 238 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  51.34 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  50.89 
 
 		 238 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  50 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  50 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  49.54 
 
 		 239 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  49.54 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.02 
 
 		 238 aa  214  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.25 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.25 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.33 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  46.33 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  45.7 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  47.49 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.33 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  47.89 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.87 
 
 		 237 aa  205  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  46.33 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  49.77 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  45.87 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.12 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  44.5 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  42.66 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.66 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  43.36 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  43.36 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  44.5 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  44.5 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  44.5 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.8 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  42.73 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  41.01 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  41.01 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  41.01 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.01 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.01 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  42.73 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  42.2 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  43.05 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.2 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  46.61 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.36 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  44.84 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  43.17 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  43.17 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  43.17 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  43.17 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.17 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  43.17 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.17 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.44 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.23 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  43.17 
 
 		 262 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  43.05 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  42.6 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  41.78 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  42.13 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  43.11 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.22 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  43.5 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  41.28 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.1 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.11 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  41.67 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.29 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  40.83 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  40.83 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  41.28 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  41.28 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  41.74 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  41.28 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  42.34 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  42.34 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  41.2 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>