More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2325 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 232 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  100 
 
 		 232 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  97.84 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  76.19 
 
 		 231 aa  341  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.86 
 
 		 231 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1108  Tol-Pal system TolQ  74.55 
 
 		 224 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00793891  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.48 
 
 		 230 aa  285  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  54.95 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  53.48 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  53.04 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  52.61 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  51.74 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  51.3 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  50.66 
 
 		 239 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 		 237 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  48.91 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  50.92 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  51.38 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  50 
 
 		 274 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.9 
 
 		 308 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  49.55 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  49.33 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.83 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.08 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  50.7 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  50 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  51.6 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  51.6 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  50.46 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  51.6 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  49.13 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.36 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  51.15 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  46.64 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  45.16 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  45 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  45 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  45 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  45 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.55 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.08 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  45.16 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  45.16 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  42.01 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  42.01 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  44.5 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  42.01 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  44.04 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.55 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.01 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  44.04 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  43.12 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  42.73 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.47 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  44.09 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  44.44 
 
 		 227 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.73 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.5 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  42.66 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  42.27 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  44.8 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  44.09 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  43.69 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  44.09 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.05 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  44.8 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  47.27 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  42.66 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  42.66 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.33 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  43.58 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  42.59 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  46.08 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.15 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  44.14 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.55 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  42.08 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.44 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.83 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  43.95 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.2 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  44.59 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  45.03 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  44.04 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  44.04 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  44.04 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  44.04 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0872  colicin uptake protein TolQ  44.04 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0427185  normal  0.214895 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.69 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  43.69 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>