More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6884 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.72 
 
 		 237 aa  443  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  91.98 
 
 		 237 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.3 
 
 		 237 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.72 
 
 		 237 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  90.68 
 
 		 236 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  91.63 
 
 		 227 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  77.25 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  67.51 
 
 		 241 aa  322  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  66.8 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  68.22 
 
 		 238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  66.1 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  67.37 
 
 		 238 aa  315  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  65.68 
 
 		 238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  65.68 
 
 		 238 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  65.68 
 
 		 238 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  66.81 
 
 		 236 aa  307  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  66.38 
 
 		 236 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  66.38 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  66.81 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  65.93 
 
 		 239 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  66.37 
 
 		 239 aa  297  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  66.22 
 
 		 239 aa  295  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.16 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  61.09 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  57.21 
 
 		 235 aa  258  6e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.91 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.5 
 
 		 308 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.22 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  50.85 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.83 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  50.92 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  50 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.38 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.46 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.47 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.2 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.25 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.73 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  44.8 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  42.27 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  43.89 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  42.27 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  42.27 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  47.71 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.82 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.04 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.27 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.4 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.17 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.22 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  42.73 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.33 
 
 		 246 aa  175  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.1 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  44.75 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  43.56 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1108  Tol-Pal system TolQ  46.33 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00793891  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  42.86 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  42.27 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  42.86 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  40.72 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  43.44 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  44.62 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  40.72 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  42.15 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  42.79 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  42.79 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  43.78 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  42.79 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  42.79 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.26 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  45.5 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.6 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  42.41 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  42.79 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  42.41 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  42.79 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  42.79 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.79 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.79 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  42.79 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  42.79 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  42.79 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.44 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.2 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.64 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  41.44 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>