More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0273 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  76.21 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  66.67 
 
 		 238 aa  326  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  68.22 
 
 		 236 aa  324  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  67.51 
 
 		 237 aa  322  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  66.67 
 
 		 238 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  65.81 
 
 		 238 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  65.81 
 
 		 238 aa  321  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.37 
 
 		 237 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.53 
 
 		 237 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  65.38 
 
 		 238 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  64.96 
 
 		 238 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.25 
 
 		 237 aa  315  6e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.64 
 
 		 227 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.68 
 
 		 237 aa  311  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  63.52 
 
 		 274 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  61.78 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  62.67 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  62.67 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.56 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  58.19 
 
 		 239 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  57.14 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  57.76 
 
 		 239 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  56.9 
 
 		 239 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  55.75 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  52.79 
 
 		 235 aa  244  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.97 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.22 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  48.95 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.79 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.11 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  49.55 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.55 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.45 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.33 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  46.79 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  45.87 
 
 		 232 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.08 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.62 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  46.52 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 		 228 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  45.16 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  45.16 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  45.16 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 		 228 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  46.08 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.7 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  45.22 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  44.95 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  42.27 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.74 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.04 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  44.29 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  42.27 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1108  Tol-Pal system TolQ  45.7 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00793891  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  41.59 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  41.59 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  42.73 
 
 		 228 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  42.73 
 
 		 228 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.05 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.5 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  43.32 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.05 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.79 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  41.94 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  41.36 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  41.36 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 221 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  43.44 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  43.44 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  43.44 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  43.44 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  43.89 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.89 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.83 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  44.04 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  41.47 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  43.42 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.12 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  43.42 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  42.01 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  44.09 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  43.12 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  41.94 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  41.82 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  41.82 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  41.82 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  41.82 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  41.82 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  41.82 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  41.82 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  41.82 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  41.82 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>