More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0528 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.9 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.22 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  46.79 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  46.58 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  40.33 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  39.75 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.34 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  44.3 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  41.2 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.57 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.38 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.49 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.08 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.4 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.35 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  43.04 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  43.04 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  43.04 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.81 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.81 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  42.62 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  41.08 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  41.89 
 
 		 248 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.2 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  40.76 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  40.61 
 
 		 232 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.98 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.35 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  41.99 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  41.56 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  41.56 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  42.4 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  39.5 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  40.61 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.04 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  39.3 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  41.05 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.07 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.32 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.78 
 
 		 288 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  38.39 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  38.39 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  38.39 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  43.7 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.84 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1395  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.35 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.95 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  42.41 
 
 		 341 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  40.64 
 
 		 239 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  42.34 
 
 		 232 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.34 
 
 		 232 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.3 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.95 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.61 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  44.23 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0857  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.23 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  42.34 
 
 		 338 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  40.91 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  37.72 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  37.22 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.93 
 
 		 366 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  36.77 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  43.86 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.74 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  41.77 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.26 
 
 		 337 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  37.17 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.37 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.42 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  37.92 
 
 		 335 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.23 
 
 		 283 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  42.42 
 
 		 292 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.63 
 
 		 400 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  41.45 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  39.65 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  41.3 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 		 421 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  41.3 
 
 		 326 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  41.3 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  43.2 
 
 		 336 aa  138  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  41.99 
 
 		 310 aa  138  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.69 
 
 		 317 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  40.87 
 
 		 324 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  35.37 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  42.61 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>