More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1395 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1395  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 228 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0857  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.83 
 
 		 228 aa  341  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  73.8 
 
 		 229 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  73.59 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  73.59 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  73.16 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.54 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  45.91 
 
 		 241 aa  174  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  45.65 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.07 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.65 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  45 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.89 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  49.02 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  48.33 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  43.86 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  48.33 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  48.33 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  45.54 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  47.86 
 
 		 325 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  46.19 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  45.07 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  46.45 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  46.45 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  46.45 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  45.07 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.98 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.05 
 
 		 232 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  45 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  48.7 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.69 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  45 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.2 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  45.58 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.58 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  43.78 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.27 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  43.27 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.46 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  46.54 
 
 		 338 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  39.57 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.78 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.44 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  41.2 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  41.2 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  44.02 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  44.98 
 
 		 274 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  41.2 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.02 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  45.16 
 
 		 292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  41.28 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.65 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.47 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  47.39 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.83 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.01 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.01 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  40.37 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.01 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.01 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  47.34 
 
 		 359 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.47 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 		 337 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  45.16 
 
 		 310 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.24 
 
 		 313 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.2 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  44.14 
 
 		 335 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  45.98 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  49.21 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.06 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  41.01 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.47 
 
 		 301 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.61 
 
 		 400 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.26 
 
 		 366 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  40.76 
 
 		 303 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.74 
 
 		 320 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.92 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.67 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.36 
 
 		 421 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  47.62 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  44.5 
 
 		 316 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.8 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  41.1 
 
 		 323 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  41.74 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.81 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  44.44 
 
 		 355 aa  144  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.55 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.47 
 
 		 320 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  42.73 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  41.95 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  41.1 
 
 		 324 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  41.1 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  41.1 
 
 		 326 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>