More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1900 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
233 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
233 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  99.14 
 
 
233 aa  460  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.65 
 
 
229 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1395  MotA/TolQ/ExbB proton channel  73.59 
 
 
228 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0857  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.11 
 
 
228 aa  291  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.29 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.81 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  45.95 
 
 
241 aa  171  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.05 
 
 
231 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.37 
 
 
308 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.48 
 
 
237 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  44.07 
 
 
238 aa  167  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  40.56 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.07 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  44.34 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  41.28 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  41.7 
 
 
241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.7 
 
 
227 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  43.6 
 
 
238 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  41.6 
 
 
238 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.08 
 
 
232 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.73 
 
 
227 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.08 
 
 
232 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  46.08 
 
 
232 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 
247 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  43.6 
 
 
238 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  43.6 
 
 
238 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  43.19 
 
 
237 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  43.6 
 
 
238 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.66 
 
 
237 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  48.77 
 
 
232 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  43.13 
 
 
238 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.01 
 
 
228 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.72 
 
 
237 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 
227 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.01 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  42.86 
 
 
335 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  44.44 
 
 
327 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  40.55 
 
 
228 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  40.55 
 
 
228 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  40.55 
 
 
228 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  40.09 
 
 
229 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  49.47 
 
 
292 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
228 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  43.97 
 
 
338 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
228 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  41.74 
 
 
229 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.88 
 
 
238 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
228 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
228 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.86 
 
 
232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  47.03 
 
 
325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.92 
 
 
233 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.37 
 
 
229 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  42.51 
 
 
232 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  45.37 
 
 
239 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  48.95 
 
 
310 aa  151  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.45 
 
 
222 aa  151  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 
229 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  44.55 
 
 
236 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 
229 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  45.31 
 
 
235 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  43.56 
 
 
236 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.59 
 
 
229 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  43.56 
 
 
236 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 
231 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.37 
 
 
236 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 
288 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.17 
 
 
266 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  44.62 
 
 
320 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.12 
 
 
337 aa  148  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  42.65 
 
 
326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.27 
 
 
320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  43.59 
 
 
323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  44.1 
 
 
324 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.23 
 
 
366 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  41.94 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  41.4 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  47.26 
 
 
242 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.1 
 
 
317 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  37.24 
 
 
230 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.74 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  37.24 
 
 
230 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  43.5 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  42.44 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  41.67 
 
 
257 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.67 
 
 
230 aa  144  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  39.06 
 
 
239 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  41.63 
 
 
227 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  39.91 
 
 
234 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  42.34 
 
 
359 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.49 
 
 
286 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  42.41 
 
 
274 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  44.83 
 
 
239 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  41.58 
 
 
229 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
313 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0670804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>