More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0331 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 232 aa  456  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  59.13 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.55 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.89 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.43 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  49.34 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.98 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.53 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.53 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.53 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  47.83 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  47.47 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  46.29 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  47.16 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  46.29 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  47.39 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.35 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  47.17 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  44.74 
 
 		 241 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  45.18 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  43.36 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  43.04 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.54 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  42.79 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  42.24 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.09 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  43.05 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.35 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  43.04 
 
 		 239 aa  174  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  43.05 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  43.05 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  41.05 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  42.36 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.38 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  39.73 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  41.44 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  42.33 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  42.33 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  41.26 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  41.86 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  41.86 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.73 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  42.29 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  41.86 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  41.86 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  42.29 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  42.29 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  42.79 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.18 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.85 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.45 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.1 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  40.36 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  40.81 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.85 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.26 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.85 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.85 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  40.44 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.85 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.29 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  38.74 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  41.78 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  40.54 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  38.26 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0970  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.59 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  38.68 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  41.94 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3137  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.09 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.94 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.21 
 
 		 400 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.3 
 
 		 337 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  38.68 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  39.62 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  39.62 
 
 		 227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.7 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.73 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 		 421 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  37.5 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  38.67 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  38.67 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  39.45 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  40.49 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  40.49 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.29 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  41.78 
 
 		 359 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  40 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2368  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.83 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  34.96 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.5 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  43.33 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  40.18 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.19 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>