More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3598 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3598  tonB-system energizer ExbB  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3761  tonB-system energizer ExbB  74.41 
 
 		 296 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0388  tonB-system energizer ExbB  64.46 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0345  tonB-system energizer ExbB  64.58 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  73.14 
 
 		 244 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  73.14 
 
 		 244 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  73.14 
 
 		 244 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.512684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  73.14 
 
 		 244 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  72.73 
 
 		 244 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  70.66 
 
 		 244 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  70.66 
 
 		 244 aa  348  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  70.66 
 
 		 244 aa  348  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  70.66 
 
 		 244 aa  348  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  70.66 
 
 		 244 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  70.66 
 
 		 244 aa  348  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  70.66 
 
 		 244 aa  348  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  70.25 
 
 		 244 aa  346  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  70.25 
 
 		 244 aa  345  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  70.29 
 
 		 238 aa  333  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  67.93 
 
 		 323 aa  312  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  64.34 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  63.95 
 
 		 330 aa  301  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  67.51 
 
 		 237 aa  299  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.44 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  59.27 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  60.25 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  60.25 
 
 		 326 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  62.73 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  59.83 
 
 		 324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.47 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  56.9 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  58.22 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.39 
 
 		 366 aa  225  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.59 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.85 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.32 
 
 		 421 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  55.31 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  51.08 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.07 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.67 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  56.82 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  54.84 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1612  ExbB  50.65 
 
 		 310 aa  211  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  50.4 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1432  tonB-system energizer ExbB  54.63 
 
 		 257 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.44 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.83 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  55.2 
 
 		 327 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  53.7 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.41 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  49.41 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.3 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2228  biopolymer transport  53.7 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  50.88 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3697  tonB-system energizer ExbB  46.72 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.7 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.49 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.59 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.53 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.7 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  54.38 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  45.9 
 
 		 274 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3543  biopolymer transport protein ExbB  51.34 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  51.63 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  48.92 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.83 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  44.35 
 
 		 349 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.54 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  41.1 
 
 		 253 aa  153  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  38.43 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0173  putative tonB-system energizer ExbB  58.2 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.77 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.56 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.44 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  40.09 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  43.08 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.91 
 
 		 238 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.43 
 
 		 231 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.23 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  38.12 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 		 229 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  40.31 
 
 		 236 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  37.62 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  39.44 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  39.91 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.49 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.79 
 
 		 237 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  42.36 
 
 		 239 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  43.59 
 
 		 232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.92 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.98 
 
 		 233 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  40.5 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  40.5 
 
 		 236 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  41.36 
 
 		 236 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>