More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4481 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
230 aa  463  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  95.22 
 
 
230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.14 
 
 
238 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.41 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.22 
 
 
240 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.94 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  56.02 
 
 
235 aa  227  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.02 
 
 
235 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57 
 
 
244 aa  227  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.56 
 
 
234 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  57.89 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.37 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  58.71 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  58.71 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.2 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.21 
 
 
239 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.14 
 
 
241 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  57.07 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  56.59 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  56.59 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.71 
 
 
232 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.1 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.14 
 
 
218 aa  171  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.24 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.78 
 
 
238 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.22 
 
 
250 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.62 
 
 
250 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.46 
 
 
247 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.2 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.57 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  39.81 
 
 
225 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0220  putative transport-related membrane protein  42.65 
 
 
221 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 
223 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 
223 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.02 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.44 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.85 
 
 
263 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.2 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.32 
 
 
222 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  37.75 
 
 
224 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 
303 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 
303 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 
301 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  37.75 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.2 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.42 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.42 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  36.76 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 
304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.54 
 
 
266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.06 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  37.37 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  39.13 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.3 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.57 
 
 
237 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  40.29 
 
 
253 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.19 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.2 
 
 
233 aa  128  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.45 
 
 
311 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.2 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.69 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.15 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.78 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  38.81 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3921  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.95 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.14 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.28 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3269  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.95 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.18 
 
 
229 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0862  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.286551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.11 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.76 
 
 
278 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.58 
 
 
225 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.27 
 
 
246 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.87 
 
 
286 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.61 
 
 
230 aa  125  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.83 
 
 
222 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.47 
 
 
254 aa  124  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0409  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.76 
 
 
235 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.83 
 
 
222 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  37.5 
 
 
223 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
265 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.51 
 
 
238 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.51 
 
 
238 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
355 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.83 
 
 
222 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.21 
 
 
237 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.61 
 
 
214 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.83 
 
 
222 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
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NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.5 
 
 
243 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
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NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  34.42 
 
 
236 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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