More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3115 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.78 
 
 		 230 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.41 
 
 		 233 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.82 
 
 		 230 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.82 
 
 		 230 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.59 
 
 		 230 aa  353  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  76.52 
 
 		 235 aa  348  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.53 
 
 		 233 aa  344  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  77.53 
 
 		 233 aa  344  8e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  68.83 
 
 		 234 aa  338  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  73.42 
 
 		 227 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  72.97 
 
 		 236 aa  335  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  66.36 
 
 		 225 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  66.36 
 
 		 225 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  66.36 
 
 		 225 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  66.36 
 
 		 225 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  66.36 
 
 		 225 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  66.36 
 
 		 225 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  66.36 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  65.91 
 
 		 225 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  65.45 
 
 		 225 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  65 
 
 		 225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  65.3 
 
 		 225 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.3 
 
 		 225 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.3 
 
 		 225 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.55 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.91 
 
 		 225 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  64.68 
 
 		 225 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  65.14 
 
 		 225 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  64.22 
 
 		 225 aa  274  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  60.54 
 
 		 230 aa  274  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  60.09 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  58.15 
 
 		 231 aa  268  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  59.91 
 
 		 222 aa  264  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.37 
 
 		 228 aa  262  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  60.99 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.09 
 
 		 227 aa  254  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.09 
 
 		 227 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  51.11 
 
 		 228 aa  238  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.76 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.27 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.13 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  55.91 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  50.46 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.88 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  48.94 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  47.11 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.91 
 
 		 229 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.6 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.6 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  48.42 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  47.96 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  48.65 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  45.25 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  45.25 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  48.65 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  45.25 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.7 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.7 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  48.42 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  48 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.25 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.8 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.7 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  47.51 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.51 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  47.51 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.61 
 
 		 228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.08 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  50.23 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  50.23 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.23 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  50.23 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  50.23 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  50.23 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.61 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  51.36 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  51.36 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  49.33 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  49.77 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  49.77 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 221 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  47.69 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  48.21 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  51.11 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.78 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0872  colicin uptake protein TolQ  49.32 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0427185  normal  0.214895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  49.32 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  49.32 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  49.32 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  48.86 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  45.58 
 
 		 231 aa  205  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  48.89 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  49.32 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  48.18 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  49.54 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  49.54 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  49.54 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  49.54 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>