More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0357 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  100 
 
 		 555 aa  1101    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.35 
 
 		 551 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.16 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.8 
 
 		 655 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.57 
 
 		 598 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.58 
 
 		 607 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.78 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.58 
 
 		 671 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.49 
 
 		 603 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.08 
 
 		 599 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 		 598 aa  319  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  37.87 
 
 		 615 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  37.48 
 
 		 608 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.03 
 
 		 594 aa  291  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.71 
 
 		 680 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.4 
 
 		 225 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.41 
 
 		 268 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  27.27 
 
 		 376 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  31.17 
 
 		 239 aa  90.1  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  29.76 
 
 		 224 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  29.81 
 
 		 224 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  25.37 
 
 		 756 aa  89  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  25.37 
 
 		 756 aa  89  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  25.37 
 
 		 756 aa  89  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  30.69 
 
 		 223 aa  88.6  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.7 
 
 		 224 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  34.34 
 
 		 220 aa  87.8  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  27.98 
 
 		 232 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  30.73 
 
 		 236 aa  87.4  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.7 
 
 		 247 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  28.7 
 
 		 257 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  28.7 
 
 		 257 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  30.28 
 
 		 236 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.94 
 
 		 243 aa  86.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  30.23 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  30.23 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  42.11 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.81 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  30 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  41.38 
 
 		 238 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  42.98 
 
 		 239 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 		 227 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  30.36 
 
 		 236 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  28.04 
 
 		 236 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.49 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  42.11 
 
 		 239 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  42.98 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  44.19 
 
 		 143 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.94 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  42.11 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.6 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  27.1 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.86 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  41.18 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.52 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  41.18 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  41.18 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.64 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.04 
 
 		 237 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.04 
 
 		 237 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  31.75 
 
 		 238 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.23 
 
 		 231 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.04 
 
 		 237 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  39.22 
 
 		 227 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.3 
 
 		 229 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  30.88 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  35.9 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  40.34 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  44 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  35.9 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  35.48 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  47.5 
 
 		 142 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  34.65 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  35.39 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  34.65 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  41.18 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  35.9 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.23 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  35.07 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  29.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0751  hypothetical protein  40.95 
 
 		 698 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0213879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.19 
 
 		 230 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  32.04 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  36.52 
 
 		 238 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  28.57 
 
 		 231 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  26.73 
 
 		 245 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  38.1 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  28.9 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  28.78 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.78 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  42.42 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.07 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>