More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2498 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  72.98 
 
 		 615 aa  848    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 599 aa  1222    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  73.16 
 
 		 608 aa  841    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.25 
 
 		 598 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.79 
 
 		 594 aa  545  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.81 
 
 		 585 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.07 
 
 		 655 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 		 680 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.64 
 
 		 671 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.58 
 
 		 607 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 603 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.12 
 
 		 598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 		 551 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  37.41 
 
 		 555 aa  280  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  34.19 
 
 		 234 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  34.38 
 
 		 227 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.98 
 
 		 235 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  33.18 
 
 		 259 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.3 
 
 		 233 aa  104  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  34.3 
 
 		 233 aa  104  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 		 233 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  33.17 
 
 		 259 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.82 
 
 		 243 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  34.7 
 
 		 257 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 		 230 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  33.33 
 
 		 236 aa  101  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  35.45 
 
 		 240 aa  101  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  34.7 
 
 		 257 aa  101  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  30.85 
 
 		 231 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  34.09 
 
 		 235 aa  100  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.18 
 
 		 231 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.71 
 
 		 228 aa  99.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.71 
 
 		 232 aa  99  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  32.29 
 
 		 227 aa  99  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  31.43 
 
 		 222 aa  98.6  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  31.78 
 
 		 236 aa  98.6  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  32.17 
 
 		 233 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  32.17 
 
 		 233 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 		 230 aa  98.6  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  33.66 
 
 		 228 aa  97.8  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  33.33 
 
 		 230 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.75 
 
 		 224 aa  97.8  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.2 
 
 		 225 aa  97.4  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  32.41 
 
 		 228 aa  97.4  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  33.33 
 
 		 230 aa  97.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  30.36 
 
 		 231 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.36 
 
 		 231 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.49 
 
 		 235 aa  97.4  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  31.86 
 
 		 236 aa  96.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  31.37 
 
 		 236 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.72 
 
 		 268 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  31.86 
 
 		 239 aa  96.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  31.94 
 
 		 228 aa  96.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  31.94 
 
 		 228 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  32.26 
 
 		 224 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.82 
 
 		 231 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  36.41 
 
 		 248 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  34.17 
 
 		 230 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  33.8 
 
 		 241 aa  95.1  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 		 229 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  34.13 
 
 		 225 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.28 
 
 		 236 aa  95.1  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  33.51 
 
 		 239 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.8 
 
 		 221 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  34.13 
 
 		 228 aa  95.1  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  31.94 
 
 		 228 aa  94.7  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.26 
 
 		 230 aa  94.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.26 
 
 		 230 aa  94.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  34.13 
 
 		 228 aa  95.1  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.01 
 
 		 227 aa  94.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  30.56 
 
 		 234 aa  94.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  34.36 
 
 		 218 aa  94.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  29.39 
 
 		 239 aa  93.6  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  26.74 
 
 		 756 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  26.74 
 
 		 756 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  26.74 
 
 		 756 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  29.49 
 
 		 226 aa  93.2  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 		 218 aa  93.6  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 225 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  32.56 
 
 		 262 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  31.31 
 
 		 228 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  31.84 
 
 		 227 aa  92.8  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  31.31 
 
 		 228 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  31.31 
 
 		 228 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  37.18 
 
 		 231 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  29.39 
 
 		 239 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  37.18 
 
 		 231 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  37.18 
 
 		 231 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.84 
 
 		 229 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.84 
 
 		 228 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  31.37 
 
 		 230 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  28.7 
 
 		 231 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  30.54 
 
 		 263 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.78 
 
 		 229 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  37.18 
 
 		 231 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  28.7 
 
 		 231 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.52 
 
 		 227 aa  92.8  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.84 
 
 		 228 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.84 
 
 		 228 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>