More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2717 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  68.89 
 
 
231 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  68.42 
 
 
230 aa  314  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.27 
 
 
224 aa  314  8e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  67.98 
 
 
230 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.12 
 
 
225 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  66.37 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  66.37 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  66.37 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  66.37 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  66.37 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  66.37 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  66.37 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  66.22 
 
 
262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  66.22 
 
 
222 aa  299  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  66.37 
 
 
225 aa  297  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  65.92 
 
 
225 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.78 
 
 
246 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.78 
 
 
242 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.36 
 
 
225 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  66.36 
 
 
225 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.36 
 
 
225 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  67.98 
 
 
230 aa  295  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.37 
 
 
227 aa  286  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  65.47 
 
 
225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.93 
 
 
227 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  65.02 
 
 
225 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  64.57 
 
 
225 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.36 
 
 
233 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.3 
 
 
230 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  59.01 
 
 
227 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  59.91 
 
 
234 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.3 
 
 
230 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.7 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  55.41 
 
 
225 aa  249  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.82 
 
 
230 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.82 
 
 
230 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.63 
 
 
225 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.46 
 
 
235 aa  245  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  59.91 
 
 
233 aa  245  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.91 
 
 
233 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  54.3 
 
 
236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  53.78 
 
 
231 aa  244  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  53.78 
 
 
231 aa  244  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.22 
 
 
231 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.67 
 
 
218 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  58.37 
 
 
240 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  54.05 
 
 
228 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  52.89 
 
 
231 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  52.89 
 
 
231 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  52.89 
 
 
231 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  52.89 
 
 
231 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  52.89 
 
 
231 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.89 
 
 
231 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.42 
 
 
221 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  56.89 
 
 
218 aa  238  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  55.05 
 
 
230 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.26 
 
 
232 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  49.56 
 
 
259 aa  230  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  51.61 
 
 
226 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  50.45 
 
 
228 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.42 
 
 
229 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.68 
 
 
229 aa  227  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  50 
 
 
237 aa  223  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  50 
 
 
237 aa  223  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  49.32 
 
 
229 aa  221  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  49.32 
 
 
229 aa  221  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.5 
 
 
236 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 
229 aa  221  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.23 
 
 
228 aa  221  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  49.77 
 
 
228 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  49.77 
 
 
228 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  49.77 
 
 
228 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.32 
 
 
229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  49.77 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.32 
 
 
228 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  50.23 
 
 
228 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.23 
 
 
229 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  49.55 
 
 
232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  49.77 
 
 
228 aa  218  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  48.4 
 
 
228 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  47.81 
 
 
257 aa  215  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  50.23 
 
 
227 aa  214  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  47.81 
 
 
257 aa  214  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.86 
 
 
227 aa  214  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  48.4 
 
 
228 aa  214  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  48.4 
 
 
228 aa  214  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  52.44 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  49.09 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  47.25 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  47.03 
 
 
228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  47.49 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  48.17 
 
 
225 aa  211  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  47.03 
 
 
228 aa  211  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  46.79 
 
 
227 aa  210  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  47.3 
 
 
236 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>