27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0292 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1520    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1520    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1520    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.33 
 
 		 598 aa  132  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.07 
 
 		 603 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.57 
 
 		 607 aa  107  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.16 
 
 		 598 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.53 
 
 		 551 aa  105  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.92 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.74 
 
 		 599 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  27.48 
 
 		 376 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5767  Protein of unknown function DUF2341  28.72 
 
 		 447 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.84 
 
 		 555 aa  90.1  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  24.15 
 
 		 608 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.68 
 
 		 594 aa  81.3  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  25.07 
 
 		 615 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.99 
 
 		 671 aa  76.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 		 680 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  32.06 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.78 
 
 		 655 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1054 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0751  hypothetical protein  38.39 
 
 		 698 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0213879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  27.36 
 
 		 1159 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  25.37 
 
 		 1597 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  25.37 
 
 		 1708 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1367 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  25.56 
 
 		 3507 aa  44.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>