24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5767 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5767  Protein of unknown function DUF2341  100 
 
 		 447 aa  897    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  29.97 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  28.72 
 
 		 756 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  28.72 
 
 		 756 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  28.72 
 
 		 756 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.24 
 
 		 598 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.73 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.94 
 
 		 599 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.03 
 
 		 603 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.07 
 
 		 598 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  24.56 
 
 		 608 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.57 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.11 
 
 		 680 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.28 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.46 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.08 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  29.03 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.11 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  27.03 
 
 		 555 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.89 
 
 		 555 aa  60.1  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0751  hypothetical protein  33.63 
 
 		 698 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0213879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.12 
 
 		 3507 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1054 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.34 
 
 		 1424 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>