More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2199 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 594 aa  1189    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.02 
 
 		 599 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.39 
 
 		 598 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  52.09 
 
 		 615 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  52.36 
 
 		 608 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.65 
 
 		 585 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.99 
 
 		 655 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.72 
 
 		 680 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.17 
 
 		 671 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.81 
 
 		 555 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.09 
 
 		 607 aa  320  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.85 
 
 		 603 aa  320  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.89 
 
 		 598 aa  286  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.04 
 
 		 551 aa  283  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  35.51 
 
 		 555 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.15 
 
 		 231 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  35.87 
 
 		 236 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.56 
 
 		 232 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  35.43 
 
 		 236 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  35.43 
 
 		 236 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.79 
 
 		 232 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  36.79 
 
 		 232 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  37.1 
 
 		 239 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  30.77 
 
 		 226 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  35.44 
 
 		 227 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  35.62 
 
 		 238 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  34.98 
 
 		 239 aa  100  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.16 
 
 		 243 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  35.48 
 
 		 236 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  35.29 
 
 		 239 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  35.29 
 
 		 239 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 		 230 aa  97.8  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  34.7 
 
 		 238 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.47 
 
 		 230 aa  97.4  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  33.19 
 
 		 238 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  32.13 
 
 		 238 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  33.19 
 
 		 238 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  34.84 
 
 		 227 aa  94.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.26 
 
 		 235 aa  93.6  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  32.77 
 
 		 241 aa  93.2  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  32.77 
 
 		 238 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  32.14 
 
 		 234 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  34.17 
 
 		 231 aa  92.8  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  33.8 
 
 		 231 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.8 
 
 		 231 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  32.62 
 
 		 228 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  31.84 
 
 		 227 aa  91.3  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  31.46 
 
 		 224 aa  90.9  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.44 
 
 		 232 aa  90.5  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.86 
 
 		 308 aa  90.5  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 		 233 aa  90.5  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  24.56 
 
 		 756 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  24.56 
 
 		 756 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  24.56 
 
 		 756 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  32.86 
 
 		 232 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.87 
 
 		 221 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  30.73 
 
 		 231 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  30.94 
 
 		 225 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  32.87 
 
 		 231 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.22 
 
 		 229 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  30.94 
 
 		 228 aa  89.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  32.87 
 
 		 231 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  30.94 
 
 		 228 aa  89.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  32.87 
 
 		 231 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  30.94 
 
 		 228 aa  89.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  36.22 
 
 		 240 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  32.87 
 
 		 231 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 		 236 aa  89  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 		 230 aa  88.2  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  32.08 
 
 		 233 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.73 
 
 		 211 aa  87.8  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  32.08 
 
 		 233 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  32.87 
 
 		 231 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  32.87 
 
 		 231 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.64 
 
 		 237 aa  87.4  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.88 
 
 		 225 aa  87.4  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  30.22 
 
 		 234 aa  87.4  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  30.28 
 
 		 236 aa  87  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.64 
 
 		 237 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  34.25 
 
 		 236 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  31.96 
 
 		 235 aa  87  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 		 231 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.86 
 
 		 268 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  31 
 
 		 228 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  30.09 
 
 		 228 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  30.09 
 
 		 228 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.49 
 
 		 235 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  31.7 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  31.7 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  30.22 
 
 		 263 aa  85.9  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  31.7 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  33.05 
 
 		 248 aa  85.9  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.94 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  31.98 
 
 		 227 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  31.7 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  31.7 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 		 229 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  31.7 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  31.7 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>