More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2920 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.56 
 
 		 671 aa  808    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 680 aa  1348    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.46 
 
 		 655 aa  787    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.05 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.15 
 
 		 585 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 		 599 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.71 
 
 		 594 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  42.77 
 
 		 615 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  41.84 
 
 		 608 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.67 
 
 		 555 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.97 
 
 		 603 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.86 
 
 		 607 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.19 
 
 		 551 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.29 
 
 		 598 aa  347  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  50.51 
 
 		 555 aa  227  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 		 225 aa  97.1  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.1 
 
 		 243 aa  94.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  32.2 
 
 		 236 aa  92  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  31.54 
 
 		 236 aa  91.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  32.64 
 
 		 248 aa  91.3  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  36.88 
 
 		 223 aa  91.3  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  30.99 
 
 		 238 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  33.18 
 
 		 236 aa  90.1  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  33.64 
 
 		 236 aa  90.5  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  31.71 
 
 		 239 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  29.29 
 
 		 237 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 263 aa  90.1  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.67 
 
 		 227 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  33.5 
 
 		 241 aa  89.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.67 
 
 		 237 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  34.12 
 
 		 238 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  27.59 
 
 		 224 aa  88.2  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  27.59 
 
 		 224 aa  88.2  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  30.73 
 
 		 233 aa  88.2  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  34.12 
 
 		 238 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  30.73 
 
 		 233 aa  88.2  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  34.12 
 
 		 238 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.88 
 
 		 237 aa  87.8  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.85 
 
 		 268 aa  87.4  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.8 
 
 		 237 aa  87.4  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  33.65 
 
 		 238 aa  87.4  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  31.7 
 
 		 274 aa  87  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 		 252 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.66 
 
 		 223 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 		 252 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  30 
 
 		 231 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.28 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  27.88 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  26.67 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  28.74 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.23 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.12 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  35.53 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  30.52 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  38.74 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  38.74 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  31.36 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  31.02 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  45.08 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.29 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  33.95 
 
 		 239 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.33 
 
 		 243 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  33.95 
 
 		 239 aa  82.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  30.56 
 
 		 230 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  31.31 
 
 		 237 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  31.31 
 
 		 237 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  29.17 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  29.17 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  29.17 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  30.88 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.89 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  29 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  45.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  29 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  30.7 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.36 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  29.74 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.75 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  41.67 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  29.95 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  30.59 
 
 		 231 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 		 230 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  27.4 
 
 		 232 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.16 
 
 		 218 aa  80.1  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  28.64 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.52 
 
 		 255 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  30.04 
 
 		 228 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  29.57 
 
 		 228 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  36.36 
 
 		 241 aa  79.7  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  40.62 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  29.95 
 
 		 227 aa  79.7  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.46 
 
 		 235 aa  79.7  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.75 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  27.83 
 
 		 245 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  28.82 
 
 		 229 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.56 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  40.62 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>