More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0468 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  77.86 
 
 		 141 aa  231  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  76.22 
 
 		 141 aa  229  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  76.92 
 
 		 145 aa  228  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  71.83 
 
 		 145 aa  211  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  61.76 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  61.83 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  57.25 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  59.56 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.05 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  59.69 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  51.43 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  52.71 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.62 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.62 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.6 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.56 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  43.8 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  48.61 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  44.19 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.51 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  40.46 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  41.73 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.96 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.57 
 
 		 607 aa  84.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  45.16 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.33 
 
 		 655 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 		 555 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  44.09 
 
 		 257 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.35 
 
 		 680 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  44.09 
 
 		 257 aa  80.1  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 		 598 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.33 
 
 		 585 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.05 
 
 		 671 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.29 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  41.94 
 
 		 259 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  42.86 
 
 		 232 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  35.71 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.88 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  35.71 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  39.13 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  36.84 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  36.84 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.04 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.04 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  38.04 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  38.04 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  32.71 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.74 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  35.87 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.96 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  44.19 
 
 		 555 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.23 
 
 		 594 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.25 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.74 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  32.46 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  39.13 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  39.13 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  38.55 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.33 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  36.84 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.58 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.74 
 
 		 231 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.96 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  40.26 
 
 		 223 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  39.58 
 
 		 236 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  35.87 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  34.44 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  38.89 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  35.87 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.87 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  36.96 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  38.89 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  36.96 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  38.55 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.41 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  36.96 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.58 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  35.87 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  34.44 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.1 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.96 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.96 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  37.5 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  35.87 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.63 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  37.86 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  33.33 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  34.78 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.68 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  41.33 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  42.11 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.87 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  36.46 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  42.11 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  34.78 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>