More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3473 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.21 
 
 		 224 aa  342  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.94 
 
 		 223 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.45 
 
 		 223 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  75.23 
 
 		 225 aa  327  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  73.76 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  72.85 
 
 		 224 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  73.04 
 
 		 224 aa  315  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  60.8 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.78 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  52.78 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  52.78 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  53.27 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  47.87 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.43 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.7 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.64 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.19 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  42.86 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  39.01 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  39.01 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.46 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  45.64 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  41.82 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  41.33 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.18 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  42.27 
 
 		 228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.28 
 
 		 235 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.45 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  41.33 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2213  Tol-Pal system TolQ  47.74 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000350133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.47 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  41.33 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.89 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  42.22 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  40.89 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  40.89 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  40.89 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2164  protein TolQ  46.12 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.23408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  39.73 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  41.01 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  41.71 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.18 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0747  protein TolQ  45.97 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.277913  normal  0.181202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  42.72 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.22 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.07 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.12 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  42.31 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  41.26 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  40.72 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  40.72 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0872  colicin uptake protein TolQ  42.22 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0427185  normal  0.214895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  40.72 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  41.44 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  42.22 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  42.22 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  42.22 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  42.22 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  40.72 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  41.44 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  39.82 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  41.44 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  40.36 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.15 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0611  ExbB/TolQ family protein  44.14 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  41.7 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  41.78 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  41.78 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  41.78 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  41.78 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  41.78 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  41.78 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  39.17 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  40.83 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  41.78 
 
 		 227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  41.78 
 
 		 227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  41.78 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  41.78 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  39.91 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  39.91 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  40.18 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  39.91 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  39.37 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.37 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  40.55 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  40.55 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  40.55 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.55 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  40.55 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.55 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  39.65 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  40.55 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.99 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  41.12 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.99 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.99 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.99 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>