More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2404 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
555 aa  1112    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.73 
 
 
655 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.74 
 
 
598 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.64 
 
 
680 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.94 
 
 
671 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.55 
 
 
585 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.66 
 
 
551 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.34 
 
 
607 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  45.55 
 
 
555 aa  365  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
599 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.33 
 
 
603 aa  346  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.87 
 
 
594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  40.03 
 
 
608 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  39.53 
 
 
615 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 
598 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  36 
 
 
236 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  36.14 
 
 
236 aa  111  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  36 
 
 
236 aa  110  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.19 
 
 
268 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.5 
 
 
243 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  31.25 
 
 
239 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  32.21 
 
 
232 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  31.94 
 
 
248 aa  101  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  33.49 
 
 
236 aa  101  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  30.23 
 
 
259 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.98 
 
 
225 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  32.21 
 
 
241 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  28.7 
 
 
259 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  33 
 
 
239 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.68 
 
 
230 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  33.33 
 
 
224 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  33.17 
 
 
233 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  34.16 
 
 
239 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  33.17 
 
 
233 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  33.33 
 
 
224 aa  98.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  33.96 
 
 
227 aa  97.8  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.8 
 
 
224 aa  97.1  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  30.69 
 
 
257 aa  96.7  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  38.51 
 
 
241 aa  96.7  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  32.18 
 
 
228 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  30.65 
 
 
257 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  31.63 
 
 
222 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  34.93 
 
 
238 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  31.15 
 
 
238 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  27.35 
 
 
274 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  34.93 
 
 
238 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  31.87 
 
 
236 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.87 
 
 
227 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  34.93 
 
 
238 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
231 aa  94.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  34.93 
 
 
238 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.87 
 
 
237 aa  94.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  32.97 
 
 
239 aa  94  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.87 
 
 
237 aa  94  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  29.29 
 
 
245 aa  93.6  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.32 
 
 
237 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  29.47 
 
 
237 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
229 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  29.22 
 
 
234 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 
233 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  34.03 
 
 
238 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
218 aa  92.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.91 
 
 
228 aa  92.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.32 
 
 
237 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  31.5 
 
 
231 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 
231 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 
221 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
230 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
223 aa  91.3  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  34.44 
 
 
218 aa  91.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  30.05 
 
 
226 aa  91.3  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
246 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  34.38 
 
 
220 aa  90.9  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
235 aa  90.5  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.09 
 
 
235 aa  90.9  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.1 
 
 
242 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.52 
 
 
229 aa  90.5  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  33.15 
 
 
240 aa  90.5  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.05 
 
 
230 aa  90.5  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.05 
 
 
230 aa  90.5  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.37 
 
 
230 aa  90.1  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
232 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  26.84 
 
 
756 aa  90.1  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  26.84 
 
 
756 aa  90.1  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  26.84 
 
 
756 aa  90.1  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  29.52 
 
 
229 aa  90.1  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  34.1 
 
 
225 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  33.33 
 
 
225 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  34.1 
 
 
225 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
225 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  34.68 
 
 
225 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  31.58 
 
 
230 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
225 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  31.53 
 
 
225 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  31.25 
 
 
227 aa  89  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  30.69 
 
 
262 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
223 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  34.03 
 
 
233 aa  89  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.03 
 
 
233 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  31.1 
 
 
230 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>