More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2992 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.2 
 
 		 671 aa  718    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.46 
 
 		 680 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 655 aa  1317    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.3 
 
 		 598 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.87 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  42.83 
 
 		 615 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.33 
 
 		 599 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  43.47 
 
 		 608 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.7 
 
 		 594 aa  435  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.73 
 
 		 555 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.8 
 
 		 607 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.47 
 
 		 551 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.72 
 
 		 598 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  49.32 
 
 		 555 aa  228  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.86 
 
 		 243 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  30.18 
 
 		 236 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.96 
 
 		 268 aa  94.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  29.82 
 
 		 238 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  35.23 
 
 		 238 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  35.23 
 
 		 238 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  29.73 
 
 		 237 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  35.23 
 
 		 238 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.13 
 
 		 227 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  31.48 
 
 		 227 aa  92.8  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.13 
 
 		 237 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.13 
 
 		 223 aa  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  36.08 
 
 		 238 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  30.23 
 
 		 232 aa  90.5  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.22 
 
 		 263 aa  90.1  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 		 234 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.07 
 
 		 224 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  35.75 
 
 		 223 aa  90.5  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  36.18 
 
 		 241 aa  90.5  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  31.16 
 
 		 238 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  28.93 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  28.93 
 
 		 224 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.33 
 
 		 222 aa  89  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 		 225 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.53 
 
 		 237 aa  89  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.53 
 
 		 237 aa  87.8  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  29.86 
 
 		 220 aa  87.8  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.98 
 
 		 229 aa  87.8  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  31.28 
 
 		 248 aa  87.4  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  32.65 
 
 		 239 aa  87.4  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.93 
 
 		 237 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  30.28 
 
 		 225 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  28.81 
 
 		 239 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.14 
 
 		 223 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  27.05 
 
 		 229 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  29.49 
 
 		 224 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  29 
 
 		 234 aa  86.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.22 
 
 		 236 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  29.26 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  29.49 
 
 		 224 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  33.33 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  29.05 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  28.81 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  32.8 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  28.95 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  28.24 
 
 		 237 aa  83.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  28.43 
 
 		 257 aa  83.2  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  28.24 
 
 		 237 aa  83.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  27.82 
 
 		 229 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.42 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  29.77 
 
 		 224 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  32.9 
 
 		 236 aa  82.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  28.43 
 
 		 257 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.78 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  28.51 
 
 		 236 aa  82  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  27.59 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  43.33 
 
 		 143 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.65 
 
 		 232 aa  82  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  28.02 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  27.59 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  28.02 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  30.23 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  28.87 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  28.32 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.07 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.07 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.07 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.5 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  29.79 
 
 		 236 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  30.3 
 
 		 234 aa  80.5  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.86 
 
 		 229 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  28.7 
 
 		 263 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.69 
 
 		 224 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  27.98 
 
 		 233 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  28.82 
 
 		 228 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  30.09 
 
 		 230 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.23 
 
 		 238 aa  79.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.99 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  28.63 
 
 		 228 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  28.24 
 
 		 228 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  30.47 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.98 
 
 		 233 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  28.99 
 
 		 227 aa  79.7  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.81 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>