More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2105 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 585 aa  1160    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.13 
 
 		 598 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.81 
 
 		 599 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  51.28 
 
 		 608 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  50.17 
 
 		 615 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 		 655 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.31 
 
 		 680 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.05 
 
 		 671 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.21 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.19 
 
 		 607 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 		 603 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.73 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.54 
 
 		 551 aa  359  8e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.3 
 
 		 598 aa  346  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  40.68 
 
 		 555 aa  325  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  26.92 
 
 		 756 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  26.92 
 
 		 756 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  26.92 
 
 		 756 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.2 
 
 		 268 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.25 
 
 		 231 aa  92.8  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  34.31 
 
 		 231 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  33.17 
 
 		 241 aa  89.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.36 
 
 		 234 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.72 
 
 		 311 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  31.92 
 
 		 238 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  33.5 
 
 		 236 aa  87.8  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  31.92 
 
 		 238 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  31.92 
 
 		 238 aa  87  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 		 221 aa  87  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  32.18 
 
 		 233 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  31.46 
 
 		 238 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  32.18 
 
 		 233 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  31.46 
 
 		 238 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  30.88 
 
 		 231 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.88 
 
 		 231 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  46.08 
 
 		 239 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 		 243 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  33.71 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  33.71 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  31.63 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  33.71 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.61 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  33.71 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.52 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  31.92 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  41.51 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.18 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  25.08 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  32.52 
 
 		 236 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  46.08 
 
 		 239 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  43.14 
 
 		 239 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  29.15 
 
 		 224 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  29.15 
 
 		 224 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  32.86 
 
 		 236 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 		 218 aa  83.2  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  46.08 
 
 		 239 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  33.71 
 
 		 231 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.48 
 
 		 228 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  33.71 
 
 		 231 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  33.01 
 
 		 236 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.35 
 
 		 237 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 		 237 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.61 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.71 
 
 		 237 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  29.95 
 
 		 224 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  30.49 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.61 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.33 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.6 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.62 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  31.71 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  36.62 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.43 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  34.34 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.54 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  29.47 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  28.7 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  30.59 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  39.82 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  31.18 
 
 		 257 aa  80.1  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  31.18 
 
 		 257 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  42.71 
 
 		 145 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  34.55 
 
 		 220 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.99 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.61 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  41.07 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  31.07 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  31.07 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  30 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  43.33 
 
 		 143 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  30.69 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  36.31 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.51 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.69 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  45.88 
 
 		 141 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.98 
 
 		 231 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  29.52 
 
 		 262 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  26.47 
 
 		 232 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  30 
 
 		 4433 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>