33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0751 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0751  hypothetical protein  100 
 
 		 698 aa  1423    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0213879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1252  hypothetical protein  45.05 
 
 		 624 aa  85.9  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  40.95 
 
 		 555 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.07 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.35 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.05 
 
 		 671 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1432  hypothetical protein  39.58 
 
 		 592 aa  67.8  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0853  hypothetical protein  29.08 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.46012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  29.08 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 		 585 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  29.93 
 
 		 608 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  38.39 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.74 
 
 		 680 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  38.39 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  38.39 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.61 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 		 598 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.21 
 
 		 603 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1243  hypothetical protein  36.11 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0274509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0712  hypothetical protein  37.23 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.7 
 
 		 555 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.97 
 
 		 655 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3126  PKD  33.33 
 
 		 1162 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0241283  unclonable  0.0000395166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0947  hypothetical protein  31.76 
 
 		 730 aa  55.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  39.51 
 
 		 376 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1526  hypothetical protein  32.26 
 
 		 525 aa  55.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.97 
 
 		 3507 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  52  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.337156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  32.86 
 
 		 4433 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5767  Protein of unknown function DUF2341  31.43 
 
 		 447 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2388  hypothetical protein  28.36 
 
 		 352 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>