12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1526 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0947  hypothetical protein  93.73 
 
 
730 aa  721    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1526  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1075    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3126  PKD  33.14 
 
 
1162 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0241283  unclonable  0.0000395166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  40.45 
 
 
4433 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0751  hypothetical protein  32.26 
 
 
698 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0213879 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0853  hypothetical protein  27.22 
 
 
638 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.46012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  46.38 
 
 
3507 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2388  hypothetical protein  33.77 
 
 
352 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1524  hypothetical protein  51.16 
 
 
189 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.24 
 
 
551 aa  44.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2623  hypothetical protein  34.15 
 
 
216 aa  44.3  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1254  hypothetical protein  23.27 
 
 
615 aa  43.5  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.337156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>